Il sito, accessibile dal Nintendo DSi o da un altro dispositivo in grado di navigare in Internet, come il computer o il Wii, rappresenta una piattaforma centrale per gli utenti di Flipnote Studio e per le loro creazioni. Collegando a Internet il Nintendo DSi, puoi caricare i tuoi Flipnote per mostrarli ad altri utenti o scaricare i lavori altrui per ammirarli in qualsiasi momento. Accedendo al sito da un altro dispositivo potrai vedere tutti i Flipnote postati sul sito.

Indipendentemente da come accedi al sito Flipnote Hatena, puoi mostrare il tuo apprezzamento per i tuoi Flipnote preferiti, esprimendo il tuo giudizio in stelle e postando il tuo commento. Puoi anche scaricare i Flipnote sul tuo Nintendo DSi e modificarli o arricchirli, sempre che non siano stati bloccati dall'autore. Poi li puoi postare nuovamente affinché tutta la comunità di Flipnote Hatena possa ammirarli di nuovo.

Sul sito, i Flipnote sono suddivisi in una serie di canali tematici, quindi è facile navigare tra tutte le creazioni e trarre un po' d'ispirazione dagli altri utenti di Flipnote Studio, che sfruttano al massimo il potenziale di questa applicazione. Puoi anche visitare la speciale pagina Flipnote Central, per scoprire tutti i Flipnote creati da animatori e artisti leggendari come Aardman Studios, Yoichi Kotabe e Tatsunoko Production.

Connettiti ad altri utenti di Flipnote Studio, così potrete scambiarvi le vostre creazioni, valutarle e lodarle. Infatti, anche tu fai parte della comunità di utenti creativi che s'incontra sul sito di Flipnote Hatena.